- Zakład Biologii i Ekologii Ptaków
- Zakład Ekologii Behawioralnej
- Zakład Ekologii Roślin i Ochrony Środowiska
- Zakład Hydrobiologii
- Zakład Morfologii Zwierząt
- Zakład Ochrony Wód
- Zakład Taksonomii i Ekologii Zwierząt
- Zakład Taksonomii Roślin
- Zakład Zoologii Ogólnej
- Zakład Zoologii Systematycznej
- Pracownia Aeropalinologii
- Pracownia Biologii Ewolucyjnej
- Pracownia Ekologii Populacyjnej